農業(yè)環(huán)境的監(jiān)測在目前還未列入國家建設計劃，而且農業(yè)環(huán)境監(jiān)測站的設備條件很不整齊，實際的監(jiān)測能力差別很大。只有約1/3的省級站具備相對完善的污染監(jiān)測條件,部分監(jiān)測站僅依靠所了解的一般性知識進行經驗性環(huán)境調查、觀察報告和管理;一般地縣級監(jiān)測站僅3~5人,沒有實驗室,工作開展受到很大限制。在過去十多年來,由于缺乏必要的監(jiān)測設備、方法、標準和人力,一直未開展農區(qū)生態(tài)系統(tǒng)指標的監(jiān)測。農業(yè)環(huán)境監(jiān)測站在近幾年來逐漸的被推廣應用，是現(xiàn)代農業(yè)發(fā)展的里程碑。
　　
　　各級農業(yè)環(huán)境監(jiān)測部門的日常工作大多局限于環(huán)境調查、報告編寫、宣傳培訓等方面,除了湖北、重慶站結合三峽監(jiān)測任務開展了水土流失、作物病蟲害等生態(tài)指標監(jiān)測外,其它所有農業(yè)環(huán)境監(jiān)測站都未開展生態(tài)指標監(jiān)測。各級農業(yè)環(huán)境監(jiān)測部門在重大農業(yè)環(huán)境污染事故的仲裁處理、重大建設工程對農業(yè)環(huán)境的影響評價、農業(yè)清潔生產新技術的研究與基地開發(fā)等方面參與能力不足或參與程度不夠。農業(yè)環(huán)境監(jiān)測站的應用范圍還比較局限。
　　
　　各級財政應進一步加大投入力度,加強農業(yè)環(huán)境監(jiān)測體系的能力建設，農業(yè)環(huán)境監(jiān)測站的應用逐漸的推廣應用。改善辦公及監(jiān)測環(huán)境,添置先進的儀器設備,首先保證各省級站具備相對完善的常規(guī)監(jiān)測條件。由于生態(tài)農業(yè)縣建設發(fā)展,基本農田保護區(qū)逐步劃定,生物多樣性工作逐步開展,對生態(tài)監(jiān)測提出了迫切要求。當前農業(yè)環(huán)境監(jiān)測體系缺乏生態(tài)監(jiān)測手段,必須補充生態(tài)監(jiān)測設備與能力,以便承擔農牧區(qū)生態(tài)監(jiān)測任務。力爭建立以農業(yè)部環(huán)境監(jiān)測總站為工作站的全國農業(yè)環(huán)境信息網絡,實現(xiàn)數據資料計算機網絡傳輸,及時準確地為管理、科研及生產服務。

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